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202504月23日

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发布日期:2025-04-23 08:13    点击次数:69

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扬子晚报网11月18日讯(记者 梅建明)近日,由南京农业大学国度大豆校正中心的邢光南副教悔主导并初度生效拼装和拦截了我国迫切经济虫豸豆天蛾基因组。这一效能,不仅让东谈主们对豆天蛾的领略达到了一个全新高度,也为后续了解豆天蛾发育进程中复杂的调控机制、优化豆天蛾的东谈主工衍生手艺提供了选藏的数据资源。

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图为本年暑假期间,邢光南副教悔与学生在田间接头有盘算豆天蛾衍生专用品种筛选身手

据先容,豆天蛾,其幼虫别名豆丹,原是农民口中所称的危害大豆的大青虫、大害虫。然则,因豆天蛾养分价值高,含有多种东谈主体必需氨基酸,可行为优质卵白开始。跟着经济发展以及东谈主们对健康饮食的怜惜,豆天蛾需求越发应许,其东谈主工衍生也快速兴起,并已成为江苏连云港等地区的迫切好意思食。

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图为豆天蛾基因组特质

邢光南副教悔告诉扬子晚报紫牛新闻记者,在连络中,他萌生了探索豆天蛾基因组的看法。2023年10月,他辅导颜宇璐等连络生团队驱动了豆天蛾基因组拼装、拦截的使命。团队蚁集了五龄豆天蛾幼虫,用作基因组测序拼装的施行对象。通过纠合PacBio HiFi、Hi-C手艺,初度拼装了豆天蛾高质料染色体水平基因组。拼装的基因组大小为477.45百万碱基对(Mb),contig N50为17.43 Mb。经过Hi-C搭建后,contigs被拼装到29条染色体上,挂载率为99.61%。该基因组通用单拷贝同源基因基准无缺性为99.49%,意味着简直统统的迫切基因皆依然被正确识别。基因组包含252.16 Mb的重叠元件和14,214个卵白质编码基因。这些信息关于领略豆天蛾的生物学特质至关迫切。通过比拟豆天蛾与香烟天蛾的基因组发现两者具有很强的共线性,香烟天蛾28号染色体与豆天蛾15号和29号染色体之间发生过染色体间分别或交融。而比拟豆天蛾与家蚕的基因组,发现豆天蛾染色体与家蚕染色体共线性进程较低,即染色体间交融和断裂的恬逸更频频。

此外,该连络团队还拦截了一条环化且无缺的线粒体基因组序列,长度为15,417 bp。线粒体是细胞的能量工场,这条无缺的线粒体基因组为连络豆天蛾的能量代谢提供了迫切踪影。该文发表于Scientific Data. 2024, 11: 1062。本次拼装的豆天蛾基因组,将为豆天蛾的深刻连络,以及豆天蛾衍生手艺的优化提供新想路、新决策。该课题组前期连络适度 流露春播高感大豆品种南农89-29,莳植密度1万株/亩,在大豆V6期挂卵,挂卵密度1.7万粒/亩,可赢得豆天蛾幼虫产量174斤/亩。

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图为从外环到内环纪律流露的是染色体长度散布、GC含量、基因密度以及转座元件(DNA转座子、SINE、LINE和LTR)的散布

不久前,在邢教悔等群众的指点下,南京农业大学农学院学生石一涵等组建了豆天蛾暑期社会握行团,赴淮安、连云港等地围绕豆天蛾衍生情况张开握行调研,为处理豆天蛾东谈主工衍生中的难养、低产问题建议处理身手,积极促进当地联系产业的健康发展。

 

校对 陶善工开yun体育网